Protokoly používané v QSAR

QSAR je zkratka pro kvantitativní vztah mezi strukturou a aktivitou. Používá se ukázat, jak může být kvantitativně chemická struktura souvisí s konkrétním procesu, je QSAR často používá pro navrhování léky a drogy. Tato metoda se používá pro vedení chemické syntézy, protože existuje mnoho tisíce různých možných struktur pro jednu molekulu a vědci by jinak odpad spoustu času testováním každý strukturu. Statistiky hrají důležitou roli v metodice QSAR. Vícenásobná lineární regrese

Vícenásobná lineární regrese se používá, když existuje několik studií, které používají jsou spojené na jeden konkrétní chemické struktury. Rovnice je vyvinut, že, například, může ukázat vztah mezi snížením velikosti nádoru a přítomnost hydrofobní skupiny na čtvrté pozici fenylového kruhu. Tato analýza snižuje mnoho různých látek, takže vztah lze interpretovat pouze pomocí několika parametrů, které jsou nejdůležitější.
Rozpoznávání

Rozpoznávání slouží k definování parametrů , které jsou výsledkem jsou specifické chemické struktury seskupeny. Existuje několik různých typů analýz rozpoznávání, mezi něž patří analýza hlavních komponent, počítačového automatizovaného hodnocení struktury a automatizovanou analýzu dat pomocí metod rozpoznávání. Statistika rozpoznávání vzorů používat původní data a bude korelovat různé struktury s biologickými výsledků založených na různých rozměrů, s nejvýznamnější bytosti v prvním vypočtené složky.
Srovnávací analýza molekulární pole

Tato verze QSAR se dílčí analýzy nejmenších čtverců spárovaný s křížovou validací vytvořit předpovědi pro biologickou aktivitu. V tomto typu metodiky, vědec bude přiřadit konkrétní pravidla pro vyrovnání molekulární struktury. Každý z molekul je vhodný do sítě a pak se různé interakce se vypočítá na základě interakcí z sondy atomem do různých sítí. Existuje mnoho různých rovnice, které mohou mít za následek. Na rozdíl od jiných typů regrese, tím vznikne rovnice, ve kterých jsou mnohem více parametrů než možných sloučenin
Apex -. 3D

Apex-3D využívá systém, který automaticky zvolí nejlepší vyrovnání a přizpůsobení pro struktury na základě potřebné biologické odpovědi z předchozích experimentů. Je možné odhalit vliv rozdílné orientaci vazby, antagonistický účinek ve srovnání s agonistickým účinkem a účinkem různých typů receptorů. To vytváří 2D a 3D topografické matice a mohou být zdrojem informací pro dvojice molekul, spíše než jednotlivé molekuly.
Genetické Funkce Sbližování

Genetické funkce přiblížení se používá, když je málo vzorky a mnoho různých proměnných, které jsou předmětem šetření, a když datové sady nemají lineární vztahy. Používá nejlépe hodnocené modely a nejhůře hodnocené modely vypočtené z nezpracovaných dat. Staví lepší a kvalitnější modely nahradí nejhůře hodnocené modely. Mnoho různých více spoje jsou pak poskytovány vědce, kteří pak vybere finální model. Podobnost mezi těmito modely jsou studovány poskytnout informace o strukturálních a biologických souvislostí.